Patronat nad klasami medycznymi sprawuje Wydział Chemii Uniwersytetu Jagiellońskiego, co dla uczniów tych klas oznacza dodatkowe zajęcia laboratoryjne i warsztatowe prowadzone przez pracowników tej uczelni. W roku szkolnym 2024/25 uczniowie klasy pierwszej o profilu medycznym brali udział w pokazach kriogenicznych. Drugoklasiści uczestniczyli w dwóch zajęciach laboratoryjnych, trzecioklasiści – w trzech (a ponadto czekały na nich zajęcia z wykorzystaniem technologii VR). Czwartoklasiści mieli możliwość korzystania z warsztatów maturalnych od października do kwietnia.

Klasy realizujące rozszerzony program z geografii są objęte patronatem Instytutu Geografii UJ.  Oznacza to dla uczniów tych klas regularne wykłady organizowane przez Instytut Geografii (odczyty Towarzystwa Geograficznego). Ponadto w zeszłym roku 2024/25 uczniowie klas pierwszych i drugich wzięli udział w Geografice – weekendowej imprezie zorganizowanej przez studentów Instytutu, natomiast trzecioklasiści uczestniczyli w laboratorium hydrologicznym i glebowym z okazji Dnia Geografa.

Klasy humanistyczne objęte zostały patronatem Wydziału Polonistyki Uniwersytetu Jagiellońskiego. W ramach profilu humanistycznego pracownicy naukowi WP UJ będą przeprowadzać wykłady popularno- naukowe, których tematyka będzie zgodna z podstawą programową z języka polskiego realizowaną w klasach licealnych w zakresie rozszerzonym. Dzięki współpracy z uniwersytetem nasi uczniowie będą mogli brać udział – w roli słuchaczy – w sesjach oraz spotkaniach naukowych organizowanych przez WP UJ, zaś najlepszym zapewniona zostanie pomoc pracowników naukowych WP UJ w rozwijaniu ich umiejętności i zainteresowań. Polonistyka UJ zobowiązała się także zapewnić tym osobom możliwość korzystania z czytelni oraz uczestniczenia w pracach studenckich kół naukowych działających przy WP UJ.

Koło fizyczne: uczniowie zainteresowani fizyką mogą rozwijać swoją pasję, uczestnicząc w zajęciach koła fizycznego, które prowadzą wieloletni praktycy i pracownicy naukowi związani z Akademią Górniczo-Hutniczą oraz Instytutem Fizyki Jądrowej PAN: mgr inż. Piotr Mazur oraz dr inż. Paweł Janowski. Ponadto uczniowie klas matematyczno-fizyczno-informatycznych i politechnicznych, dzięki współpracy z Wydziałem Elektrotechniki, Automatyki, Informatyki i Inżynierii Biomedycznej Akademii Górniczo-Hutniczej, mogą uczestniczyć w stałych dodatkowych zajęciach z matematyki prowadzonych przez pracowników naukowych uczelni oraz matematycznym obozie naukowym.